近日，中國(guó)熱科院橡膠所分子育種團(tuán)隊(duì)成功研制出基于靶向基因型檢測(cè)技術(shù)的橡膠樹(shù)40K育種芯片，對(duì)建立橡膠樹(shù)高效生物育種體系、提高天然橡膠育種自主創(chuàng)新能力具有積極意義。
研究團(tuán)隊(duì)基于4531個(gè)與橡膠樹(shù)重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的基因和QTL標(biāo)記位點(diǎn)，以及35282個(gè)在基因組均勻分布的高質(zhì)量SNP作為背景位點(diǎn)，成功研制出具有代表性、全局性和功能性標(biāo)記位點(diǎn)的橡膠樹(shù)40K育種芯片。
橡膠樹(shù)40K育種芯片具有分布均勻、多態(tài)性高等特點(diǎn)，可廣泛應(yīng)用于橡膠樹(shù)遺傳多樣性評(píng)估、種質(zhì)資源精準(zhǔn)鑒定、群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、遺傳圖譜構(gòu)建、全基因組關(guān)聯(lián)分析以及全基因組選擇育種等研究領(lǐng)域。研究團(tuán)隊(duì)利用該芯片對(duì)223份橡膠樹(shù)種質(zhì)資源開(kāi)展功能基因組分析和基因組選擇育種研究，實(shí)現(xiàn)了高效的群體劃分、種質(zhì)資源遺傳背景解析、重要農(nóng)藝性狀QTL位點(diǎn)挖掘，并開(kāi)展全基因組選擇和育種模擬，共篩選出50對(duì)具有潛在優(yōu)勢(shì)的速生親本組合，推動(dòng)橡膠樹(shù)育種從傳統(tǒng)的經(jīng)驗(yàn)育種向精準(zhǔn)高效的分子育種轉(zhuǎn)變。該芯片的研制有助于縮短橡膠育種周期，提升育種效率，加快我國(guó)橡膠樹(shù)育種技術(shù)體系升級(jí)。
橡膠樹(shù)40K育種芯片在遺傳研究和基因組育種中的應(yīng)用
相關(guān)研究成果以“Development of the rubber tree 40K breeding chip with applications in genetic study and breeding prediction”為題發(fā)表在《Industrial Crops and Products》。中國(guó)熱科院橡膠所王小波助理研究員為論文第一作者，程漢研究員為通訊作者。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、海南省科技人才創(chuàng)新項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)等項(xiàng)目資助。
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2025.120640
