


近日,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所功能基因組與分子育種研究團隊開發(fā)了木薯35K液相育種芯片,在木薯功能基因組研究與基因組選擇育種方面具有重要意義,進一步提高了我國木薯育種的自主創(chuàng)新能力。相關(guān)研究成果發(fā)表于《園藝學(xué)研究》(Horticulture Research)。
“GenoBaits Cassava35K”木薯液相育種芯片試劑盒。中國熱科院供圖
木薯(Manihot esculenta)是大戟科木薯屬植物,是全球三大重要薯類作物之一,具有耐干旱、耐貧瘠、高產(chǎn)等優(yōu)良特性。開發(fā)一種低成本、高通量、高靈活性和高效率的基因分型平臺,對于木薯功能基因組研究與基因組選擇育種具有重要意義。
單核苷酸多態(tài)性(SNP)芯片作為一種成熟的基因分型技術(shù),可用于高通量檢測基因組中的SNP位點。SNP芯片的優(yōu)勢包括高通量、精確性、可重復(fù)性和相對較低的成本。在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,SNP芯片已廣泛用于群體遺傳學(xué)分析、遺傳圖譜構(gòu)建、全基因組關(guān)聯(lián)分析和品種權(quán)保護等。
研究團隊基于377份木薯種質(zhì)全基因組SNP標記、2980種代謝物QTL和23個田間農(nóng)藝性狀等信息,篩選出基因組上高多態(tài)性、低缺失率、分布均勻的35369個SNP作為背景位點。其中,性狀緊密關(guān)聯(lián)的586個SNP作為前景位點進行探針設(shè)計,成功研發(fā)出全球首款木薯液相育種芯片“GenoBaits Cassava35K”。
該基因芯片在群體多樣性分析、系統(tǒng)發(fā)育分析、全基因組關(guān)聯(lián)分析中均具有較好的效果。該芯片的研發(fā)將有助于縮短木薯育種周期,提升育種效率,進一步提高我國木薯育種的自主創(chuàng)新能力。
該研究得到了海南省重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、熱帶作物生物育種全國重點實驗室科研專項等支持。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1093/hr/uhae305
報道鏈接:https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2025/2/539159.shtm
近日,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所功能基因組與分子育種研究團隊開發(fā)了木薯35K液相育種芯片,在木薯功能基因組研究與基因組選擇育種方面具有重要意義,進一步提高了我國木薯育種的自主創(chuàng)新能力。相關(guān)研究成果發(fā)表于《園藝學(xué)研究》(Horticulture Research)。
“GenoBaits Cassava35K”木薯液相育種芯片試劑盒。中國熱科院供圖
木薯(Manihot esculenta)是大戟科木薯屬植物,是全球三大重要薯類作物之一,具有耐干旱、耐貧瘠、高產(chǎn)等優(yōu)良特性。開發(fā)一種低成本、高通量、高靈活性和高效率的基因分型平臺,對于木薯功能基因組研究與基因組選擇育種具有重要意義。
單核苷酸多態(tài)性(SNP)芯片作為一種成熟的基因分型技術(shù),可用于高通量檢測基因組中的SNP位點。SNP芯片的優(yōu)勢包括高通量、精確性、可重復(fù)性和相對較低的成本。在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,SNP芯片已廣泛用于群體遺傳學(xué)分析、遺傳圖譜構(gòu)建、全基因組關(guān)聯(lián)分析和品種權(quán)保護等。
研究團隊基于377份木薯種質(zhì)全基因組SNP標記、2980種代謝物QTL和23個田間農(nóng)藝性狀等信息,篩選出基因組上高多態(tài)性、低缺失率、分布均勻的35369個SNP作為背景位點。其中,性狀緊密關(guān)聯(lián)的586個SNP作為前景位點進行探針設(shè)計,成功研發(fā)出全球首款木薯液相育種芯片“GenoBaits Cassava35K”。
該基因芯片在群體多樣性分析、系統(tǒng)發(fā)育分析、全基因組關(guān)聯(lián)分析中均具有較好的效果。該芯片的研發(fā)將有助于縮短木薯育種周期,提升育種效率,進一步提高我國木薯育種的自主創(chuàng)新能力。
該研究得到了海南省重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、熱帶作物生物育種全國重點實驗室科研專項等支持。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1093/hr/uhae305
報道鏈接:https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2025/2/539159.shtm
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