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       近日，中國熱科院椰子所聯(lián)合華大基因完成了檳榔（Areca catechu L.）基因組測序拼接及序列分析工作，全球首次完成及公布海南檳榔全基因組測序。

檳榔及其基因組進化

　　在這項研究中，通過Illumina和PacBio數(shù)據(jù)與Hi-C映射技術(shù)相結(jié)合，完成了“熱研1號”檳榔染色體水平的參考基因組組裝，檳榔基因組大小為2.51Gb，scaffold N50為1.7Mb，通過Hi-C輔助組裝技術(shù)進一步組裝成16個染色體的基因組，N50為172Mb。

　　研究分析發(fā)現(xiàn)，檳榔基因組包含31,571個蛋白質(zhì)編碼基因，92.92%的基因獲得功能注釋，參與檳榔堿、黃酮類、花青素、單萜類及其衍生物生物合成的基因家族呈現(xiàn)不同程度的富集和擴張。檳榔全基因組的發(fā)布開啟了檳榔后基因組時代，“熱研1號”檳榔參考基因組將為檳榔個體的重測序、功能基因的挖掘（抗病、優(yōu)質(zhì)、特異）和重要品質(zhì)（軟纖維、高檳榔堿等）形成機理研究、全基因組關(guān)聯(lián)分析等提供了重要的參考體系，對檳榔分子生物學研究和加快育種步伐具有里程碑意義。

　　研究成果Chromosome-scale genome assembly of areca palm (Areca catechu)在線發(fā)表于中科院JCR一區(qū)期刊《Molecular Ecology Resources》。中國熱科院椰子所楊耀東研究員、黃麗云副研究員和華大基因許春艷為論文共同第一作者，椰子所覃偉權(quán)研究員為通訊作者。

　　該項研究工作得到了中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費和物種保護等項目的支持。

　　文章鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13446